综合档案的整理需要按照一定的步骤进行，以下是一些常见的整理方法：

1.分类整理：将档案按照文件类型、部门、时间等进行分类，便于查找和管理。

2.编号标注：给每个档案件编制唯一的编号，并在档案上标注编号、名称、日期等信息，方便查找和归档。

3.文件夹管理：将档案装入文件夹，标注文件夹的名称、编号和内容，保证档案整洁有序。

4.数字化管理：将档案数字化，存储在电脑或云端，方便查找和管理。

5.备份存储：对重要档案进行备份存储，以防丢失或损坏。

6.保密管理：对涉及机密信息的档案进行保密管理，确保不被泄露。

7.定期清理：定期清理档案，删除不必要的文件，保持档案的整洁和有效性。

以上是一些常见的综合档案整理方法，可以根据实际情况选择合适的整理方式。