环保督察档案整理工作是环保督察工作的重要环节，也是保障环保督察工作质量和效果的关键。下面是做好环保督察档案整理工作的几点建议：

1. 做好档案归档工作。对于每一次环保督察工作，都应该建立相应的档案，并按照规定的流程进行归档。档案内应该包括调查报告、整改意见书、督察报告、处罚决定书等相关材料。

2. 建立完整的档案管理制度。建立档案管理制度，明确档案管理的责任和流程，规定档案的保密性和存储期限，并对档案进行分类、编号和标识，以便于查找和管理。

3. 做好档案信息化管理。采用电子档案管理系统，对督察档案进行数字化管理，提高档案检索和利用效率，确保档案信息的安全和完整性。

4. 加强档案信息共享和利用。对于涉及多个环保部门的督察案件，应该建立信息共享机制，实现信息互通、资源共享，提高督察工作的整体效能。

5. 做好档案保密工作。对于督察档案中涉及到的涉密信息，应该按照相关法律法规和规定进行保护，确保信息的安全和保密。

总之，做好环保督察档案整理工作，有助于提高环保督察工作的效率和质量，保障环境保护工作的顺利开展。