对于遵义市医院的档案整理工作，建议采取以下步骤：

1. 制定档案整理工作计划，明确工作目标、时间节点、人员分工等。

2. 对遵义市医院的档案进行分类、归档，建立档案目录，确保档案的完整性和可查性。

3. 对于存在问题的档案，如缺失、重复、损坏等，进行修复、调整、补充，保证档案的准确性和真实性。

4. 对于长期未使用的档案，按照规定进行清理和销毁，避免资源浪费和信息泄露。

5. 加强档案管理工作，建立档案保管制度，确保档案的安全和保密性。

6. 做好档案数字化工作，利用现代化技术手段对档案进行数字化处理，提高档案利用效率和管理水平。

7. 加强档案的使用和推广，为医院的科研、教育和管理提供可靠的资料支撑。