组织部整理团籍档案应该按照以下步骤进行：

1. 确定团员的基本信息，包括姓名、性别、出生年月、入团时间、团组织关系等。

2. 整理团员的个人资料，包括个人简历、学历、职业、家庭背景等。

3. 汇总团员的团组织活动记录，包括参加的团组织活动、担任的团组织职务、奖励情况等。

4. 梳理团员的思想政治表现，包括思想状况、政治立场、参与社会活动等。

5. 统计团员的组织关系转接、退团、开除团籍等情况。

6. 根据上述信息，编制团籍档案，按照团员姓名拼音字母序排列。

7. 对团籍档案进行分类、编号、归档，确保档案的安全保存和便于查阅。

8. 定期更新团籍档案，及时记录新入团员和团员的组织关系变动情况。