为了对综合档案馆的档案进行整理，可以采取以下方案：

1. 制定档案整理计划：根据档案的种类、数量、时限和重要性，制定详细的整理计划。计划包括整理的时间、人员、工具和方法等。

2. 分类整理档案：将档案按照种类、时间、地点、人物等因素进行分类，方便后续的归档和查找。

3. 清理档案：清除档案中无用的或重复的文件，保留有用的文件，并按照规定予以归档。

4. 标识档案：对归档的文件进行标识，包括分类标识、编号标识、时间标识等，方便检索和管理。

5. 建立档案数据库：将整理好的档案信息录入电子数据库，包括文件名称、编号、时间、地点、人物、内容等，方便日后的查询和利用。

6. 定期维护档案：定期对档案进行检查、整理和更新，保证档案的完整性和准确性。

综合档案馆档案整理是一项复杂的工作，需要专业知识和细致的工作态度。通过以上方案，可以有效地整理出高质量的档案，并为后续的利用和管理提供基础。